همانند سیستم تهویه پارکینگ، سیستم تهویه تونل به وسیله جت فن نیز به منظور کاهش غلظت آلاینده ها در شرایط نرمال و کنترل و تخلیه دود در شرایط حریق طراحی شده است. تهویه هوای تونل بسیار حائز اهمیت است چراکه تجمع گازهای خروجی از اگزوز خودروها همانند مونوکسید کربن در محیط تونل کیفیت هوای تونل را به شدت کاهش داده و قرار گرفتن در معرض غلظت بالای این گازهای سمی برای مدت زمان طولانی برای مسافرین و کارگران تونل بسیار خطرناک می باشد. افزایش دمای هوا و بوی نامطبوع، از دیگر نتایج افزایش غلظت این گازها می باشد. استفاده از روش های گوناگون تهویه به ویژه استفاده از جت فن ها، از غلظت این گازها می کاهد و کیفیت هوا را تا حد مطلوبی بهتر می‌کنند.
استفاده از دینامیک سیالات محاسباتی به طراحی بهینه این سیستم ها کمک شایانی می کند.